Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn12Q9ER56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms