Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr6Q9EQ16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms