Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r63Q9EPT1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms