Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms