Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl4Q9DCU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl4Q9DCU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms