Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufa8Q9DCJ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms