Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms