Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms