Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd8Q9DA37 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms