Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4bQ9D9F7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms