Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms