Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgap3Q9D8S3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfgap3Q9D8S3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap3Q9D8S3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms