Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1Q9D883 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms