Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan17Q9D7W4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms