Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp5Q9D7S9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms