Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms