Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms