Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms