Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd2Q9D3B1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd2Q9D3B1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hacd2Q9D3B1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd2Q9D3B1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd2Q9D3B1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd2Q9D3B1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd2Q9D3B1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms