Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc8Q9D2H8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms