Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef12Q9D2F1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms