Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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