Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab1bQ9D1G1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab1bQ9D1G1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms