Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc167Q9D162 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc167Q9D162 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms