Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem53Q9D0Z3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms