Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc47Q9D024 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms