Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufsp1Q9CZP0 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms