Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms