Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrs1Q9CYH6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrs1Q9CYH6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms