Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tmem39aQ9CYC3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem39aQ9CYC3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem39aQ9CYC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Tmem39aQ9CYC3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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