Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms