Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms