Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk1Q9CXB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alpk1Q9CXB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms