Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm8aQ9CWZ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm8aQ9CWZ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms