Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RpainQ9CWY9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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