Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms