Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxxc1Q9CWW7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms