Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NubplQ9CWD8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms