Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Sycp2Q9CUU3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sycp2Q9CUU3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms