Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms