Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snw1Q9CSN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms