Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msmo1Q9CRA4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msmo1Q9CRA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms