Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms