Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd1Q9CR42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd1Q9CR42 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms