Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg12Q9CQY1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms