Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.3 ms