Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PompQ9CQT5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms