Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms