Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nicn1Q9CQM0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nicn1Q9CQM0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nicn1Q9CQM0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nicn1Q9CQM0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nicn1Q9CQM0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nicn1Q9CQM0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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