Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rwdd1Q9CQK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1105.6 ms